未加以阻止和严惩，以儆效尤，而是以“防止生乱”为由，大度地放他们出城。这样一来，扬州的防守兵力更加薄弱，士气也更加低落。
六月二十四日，清军的炮兵到位，开始攻城，势单力薄的弘光守军并没有能够坚持多久，扬州在次日被清军攻陷，史可法、刘肇基等壮烈殉国。为了震慑江南的抵抗力量，彻底瓦解弘光政权的斗志，多铎下令对扬州进行惨绝人寰的大屠杀！
时扬州：诸妇女长索系颈，累累如贯珠，一步一蹶，遍身泥土；满地皆婴儿，或衬马蹄，或藉人足，肝脑涂地，泣声盈野。行过一沟一池，堆尸贮积，手足相枕，血入水碧赭，化为五色，塘为之平。
得知多铎大军进抵扬州，即将失去屏障的南京陷入一片恐慌之中。六月二十六日，弘光朝廷有人提出了“迁都”的动议，仿效南宋迁都杭州，甚至有人提议迁都到贵阳，但都是遭到时任礼部尚书钱谦益的强烈反对，只得作罢。
六月二十五日，廷会之际，此时的南京朝廷跟去年得知北京失陷后的场面区别不大，上下寂无一言。随后不到三日时间，兵部正式接到扬州失陷的战报，朝野震动不安，南京人心惶惶，携家拉口南逃者多不胜数。
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